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5'GCTACGTTCTTCATCGAT3'

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  • 更新时间:2024-01-17
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详细介绍

5'GCTACGTTCTTCATCGAT3'

引物(Primer)在聚合作用的起始时,可以刺激合成另一种大分子,并与反应物以共价键形式连接的序列。在核酸化学中,引物是一段短的单链RNA或DNA片段,可结合在核酸链上与之互补的区域,其功能是作为核苷酸聚合作用的起始点,核酸聚合酶可由其3′端开始合成新的核酸链。体外人工设计的引物被广泛用于聚合酶链反应、测序和探针合成等。

5'GCTACGTTCTTCATCGAT3'
自然中存在有生物的DNA复制引物(RNA引物)和聚合酶链式反应(PCR)中人工合成的引物(通常为DNA引物)。一般所说引物,指DNA引物,以下简称引物。

引物(Primer)在聚合作用的起始时,可以刺激合成另一种大分子,并与反应物以共价键形式连接的序列。在核酸化学中,引物是一段短的单链RNA或DNA片段,可结合在核酸链上与之互补的区域,其功能是作为核苷酸聚合作用的起始点,核酸聚合酶可由其3′端开始合成新的核酸链。体外人工设计的引物被广泛用于聚合酶链反应、测序和探针合成等。

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自然中存在有生物的DNA复制引物(RNA引物)和聚合酶链式反应(PCR)中人工合成的引物(通常为DNA引物)。一般所说引物,指DNA引物,以下简称引物。


上游引物:DNA分子两端不一样,因为核苷酸分子不是对称的,5'位有个磷酸,3'位是-OH就是:磷酸端和羟基端。DNA复制总是从5’端到3’端,因为DNA聚合酶只能往3’端加核苷酸。所以谁先复制谁上游,往后的就是下游,上游下游是个相对概念,是某一个序列/碱基相对于另一个序列/碱基而言。上游引物是靠近5'端的,下游引物是靠近3‘端的。


DNA是双链,两个链是反向平行的,DNA聚合酶顺着其中一个链走,这个链就是负链,另一个链是反着一段一段复制的,这个是正链。


正义链(sensestrand)是上游引物,反义链(antisensestrand)是下游引物,链的合成方向是从5‘~3’。上游引物又叫正向引物,下游引物叫反向引物,在设计引物的时候一般是以其中的一条链来设的,所以上游引物是与这条链相同的,而反向引物则要反向互补后才行。


上下游引物长度可以不同,主要是两条引物的Tm值要接近不然会降低扩增效率PCR扩增并不要求上下游引物一定要相同长度。但是,如果上下游引物长度相差太远,并不利于扩增反应的进行。这一点可以从primer5.0中的引物评分可以看出来。因此,除非迫不得已,建议将两条引物长度设计的相近,这样引物评分要高一些。也有利于扩增反应的进行。

引物(Primer)在聚合作用的起始时,可以刺激合成另一种大分子,并与反应物以共价键形式连接的序列。在核酸化学中,引物是一段短的单链RNA或DNA片段,可结合在核酸链上与之互补的区域,其功能是作为核苷酸聚合作用的起始点,核酸聚合酶可由其3′端开始合成新的核酸链。体外人工设计的引物被广泛用于聚合酶链反应、测序和探针合成等。


自然中存在有生物的DNA复制引物(RNA引物)和聚合酶链式反应(PCR)中人工合成的引物(通常为DNA引物)。一般所说引物,指DNA引物,以下简称引物。


上游引物:DNA分子两端不一样,因为核苷酸分子不是对称的,5'位有个磷酸,3'位是-OH就是:磷酸端和羟基端。DNA复制总是从5’端到3’端,因为DNA聚合酶只能往3’端加核苷酸。所以谁先复制谁上游,往后的就是下游,上游下游是个相对概念,是某一个序列/碱基相对于另一个序列/碱基而言。上游引物是靠近5'端的,下游引物是靠近3‘端的。


DNA是双链,两个链是反向平行的,DNA聚合酶顺着其中一个链走,这个链就是负链,另一个链是反着一段一段复制的,这个是正链。


正义链(sensestrand)是上游引物,反义链(antisensestrand)是下游引物,链的合成方向是从5‘~3’。上游引物又叫正向引物,下游引物叫反向引物,在设计引物的时候一般是以其中的一条链来设的,所以上游引物是与这条链相同的,而反向引物则要反向互补后才行。


上下游引物长度可以不同,主要是两条引物的Tm值要接近不然会降低扩增效率PCR扩增并不要求上下游引物一定要相同长度。但是,如果上下游引物长度相差太远,并不利于扩增反应的进行。这一点可以从primer5.0中的引物评分可以看出来。因此,除非迫不得已,建议将两条引物长度设计的相近,这样引物评分要高一些。也有利于扩增反应的进行。

上游引物:DNA分子两端不一样,因为核苷酸分子不是对称的,5'位有个磷酸,3'位是-OH就是:磷酸端和羟基端。DNA复制总是从5’端到3’端,因为DNA聚合酶只能往3’端加核苷酸。所以谁先复制谁上游,往后的就是下游,上游下游是个相对概念,是某一个序列/碱基相对于另一个序列/碱基而言。上游引物是靠近5'端的,下游引物是靠近3‘端的。


DNA是双链,两个链是反向平行的,DNA聚合酶顺着其中一个链走,这个链就是负链,另一个链是反着一段一段复制的,这个是正链。


正义链(sensestrand)是上游引物,反义链(antisensestrand)是下游引物,链的合成方向是从5‘~3’。上游引物又叫正向引物,下游引物叫反向引物,在设计引物的时候一般是以其中的一条链来设的,所以上游引物是与这条链相同的,而反向引物则要反向互补后才行。


上下游引物长度可以不同,主要是两条引物的Tm值要接近不然会降低扩增效率PCR扩增并不要求上下游引物一定要相同长度。但是,如果上下游引物长度相差太远,并不利于扩增反应的进行。这一点可以从primer5.0中的引物评分可以看出来。因此,除非迫不得已,建议将两条引物长度设计的相近,这样引物评分要高一些。也有利于扩增反应的进行。

 


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